تفاوت اصلى ارتدکس ها با کاتولیک ها در مرجعیت دینى است. کاتولیک ها مدعى اند پاپ جانشین پطروس مقدس مستند و تمام مسیحیان جهان باید از او تبعیت کنند اما ارتدکس ها مى کویند همه ى مناطق اسقف نشین اعتبار بکسان دارند و باهم برابرند. البته پروتستان هام مخالف این برترین و یک قدم هم جلوتر رفتند و مرجعیت یاب ها راقبول ندارند.
در سال ١٥٥٣ میلادى یک روز پاپ واتیکان نامه اى براى رقیب خودش اسقف قسطنطنیه نوشت و از او خواست برترى پاپ هاى رم را به رسمیت بشناسد و تهدید هم کرد اکر همجین کارى نکند از بدعت کذاران و پیروان کلیساى شیطان به حساب میاد. اسقف قسطنطنیه هم تمام نمایندکان جهان مسیحیت در شرق را دور هم جمع کرد و همکى باهم پاپ هاى رم را تکفیر کردند و اینجورى شد که کلیساى شرق و غرب رسما از هم جدا شدند، کلیساى غرب، کاتولیک و کلیساى شرق به نام کلیساى ارتدکس مشهور شد، یعنى راست آیین ها، کسایى که باور درست دارند.