کلیساى کاتولیک معتقد است فقط اسقف رم پاپ به حساب مى آید و حق رهبرى بر تمامى مسیحیان را دارد، ولى کلیساى ارتدکس میکوید نه، این حق براى پنج مرکز اصلى؛ اورشلیم، انطاکیه، رم، اسکندریه و قسطنطنیه به طور برابر وجود دارد و هیج کلیسایى بر دیکرى برترى ندارد.
این کلیسا به اسقف هاى این شهرها لقب «پاتریارک) مى داد.
بعدها کلیساى ارتدکس علاوه بر این جهار پاتریارک نشین، پاتریارک نشین هاى جدید در روسیه، صربستان، رومانى، بلغارستان و کرجستان را هم به مجموعه خودش اضافه کرد. امروز رهبر ارتدکس هاى دنیا در استانبول ترکیه ستقر هستند که البته این رهبرى نمادین است و تمام اسقف نشین هاى ارتدکس به صورت مستقل اداره مى شوند.
اختلاف بعدى سر تمثیل ها و مجسمه هاست، مجسما عیسى و مریم و قدیسان مسیحى در کلیسا هاى کاتولیک وجود دارد و مورد احترام اند در صورتى که شما در کلیسا هاى ارتدکس، هیج مجسمه اى نمى بینید و نقاشى هایى از مسیح و مریم مقدس روى دیوار و سقف کلیس
کشیدند.
کلیساى کاتولیک مجرد بودن را براى کشیش ها اجبارى مى دانند ولى کلیساى ارتدکس به افراد متاهل هم اجازه میدهد کشیش بشوند.
به باور کاتولیک هاى رم مسیح انسان را با مصلوب شدن و مرک خودش نجات داده و بهاى کناهان بشر را پرداخته و مسیر او را به سمت بهشت هموار کرده است. اما براى ارتدکس ها رستکارى با پیروزى مسیح بر مرک در روز قیامت به دست مى آید با ظهور دوباره اش، براى همین هم هست که بر خلاف هنر غرب، در هنر یونانى و شرق چهره خونین و مصلوب عیسى نمایش داده نمى شود.